Juan Manuel Santos fue ministro de Defensa de Colombia hasta mayo, cuando renunció para postularse a Presidente por el Partido Social de Unidad Nacional.
Esta agrupación, conocida como la ‘U’ apoyó la segunda candidatura presidencial de Álvaro Uribe, que lo llevó al Palacio de Nariño en 2006.
Santos fue nombrado Secretario de Defensa en julio de 2006.
Bajo su ministerio, las Fuerzas Armadas y policiales de Colombia participaron en algunas operaciones en contra de las Fuerzas Armadas Revolucionarias de Colombia (FARC). Por ejemplo, actuaron en los operativos en los que murieron los guerrilleros Negro Acacio, Martín Caballero, y Raúl Reyes. Además, idearon la operación Jaque, en la que se liberó a la ex candidata presidencial Íngrid Betancourt, tres estadounidenses y 11 militares y policías que estaban secuestrados.
Santos estudió Economía y Administración de Empresas en la Universidad de Kansas, EE.UU. Luego obtuvo los títulos de Magíster en Economía y Administración Pública en la London School of Economics y en la Universidad de Harvard, Estados Unidos.