El Congreso Ordinario del Fútbol que se realiza en estos moemntos en Guayaquil, aprobó un nuevo sistema de Campeonato para el torneo de la Serie B. La primera etapa se jugará en la modalidad todos contra todos. Los dos clubes que se ubiquen primeros se clasificarán a un hexagonal final. En la segunda etapa se jugarán dos hexagonales, los primeros de cada grupo accederán a la fase final y quienes repitan la ubicación recibirán una bonificación de dos puntos. Los otros dos clubes, serán los primeros de la tabla acumulada. Los dos mejores equipos de esta etapa ascenderán a la Serie A. Los clubes que no accedan a la etapa final jugarán otro hexagonal y los dos últimos de esa clasificación descenderán.
Por su parte, se decidió y aprobó además, que el jugador que por obligación deben alinear los clubes en la serie A y B, será este año Sub 19. Esa propuesta fue realiza por el Comité Ejecutivo de la Federación Ecuatoriana de Fútbol para poder así conformar la selección Sub 20 que intervendrá, en el 2013, en el Campeonato Sudamericano de esa categoría que se realizará en Argentina.