En la edición del día lunes 6 de junio, el periódico EL COMERCIO publicó una noticia bajo el siguiente titular: “15 empleados fueron despedidos de la Flacso”. En dicha nota se afirma que la decisión habría sido aprobada por el Claustro de profesores de la institución. Tal afirmación no corresponde a la realidad. En una reciente reunión del Claustro se trató sobre los ajustes que pueden ser necesarios en Flacso para enfrentar eventuales recortes presupuestarios, pero se aclaró expresamente que medidas de esa naturaleza corresponden a la dirección y no al Claustro. En consecuencia, el Claustro no tomó ninguna decisión al respecto, como se puede verificar en las respectivas actas de la reunión.
Los profesores de la sede tienen diversas opiniones sobre las decisiones últimas tomadas por la dirección y sobre la gestión que se realiza para reducir costos administrativos. Muchos de ellos han expresado su preocupación y desacuerdo con la manera en la cual los despidos a los que hace referencia la nota periodística fueron realizados.