San José de Minas está ubicada en el norte de la provincia de Pichincha (limita con Imbabura), a 80 km de Quito. La parroquia está dentro de un valle formado por las ramificaciones montañosas del nudo Mojanda Cajas. Estos cerros componen el elemento que divide las hoyas del Chota y Guayllabamba.
El origen de la parroquia tiene vestigios de culturas milenarias como la Cayapa-Colorada y la Tsáchila. Según los historiadores, los miembros de esas culturas llegaron al sector para poblar Pirca, Alance, Ascilla, Anagumba y Cochabamba.
En Minas hay pirámides, caminos, cerámica, cementerios y tumbas de los quitus.